(1) Lõheliste elupaikadena kaitstavate veekogude nimekirja on kantud veekogud, kus on lõhe (Salmo salar), meriforelli (Salmo trutta trutta), jõeforelli (Salmo trutta fario), harjuse (Thymallus thymallus), rääbise (Coregonus albula), merisiia (Coregonus lavaretus lavaretus) või peipsi siia (Coregonus coregonus maraenoides) kaitstavad elupaigad. (2) Lõheliste elupaikadena kaitstavad veekogud on järgmised:     Kood «Riigi veekatastris» 1) Ahja jõgi 2) Avijõgi 3) Jägala jõgi 4) Jänijõgi 5) Keila jõgi 6) Kunda jõgi 7) Kääpa jõgi 8) Loobu jõgi 9) Narva jõgi 10) Navesti jõgi 11) Oostriku jõgi 12) Peipsi järv 13) Pirita jõgi 14) Piusa jõgi 15) Preedi jõgi 16) Pudisoo jõgi 17) Põltsamaa jõgi 18) Pärnu jõgi 19) Pühajõgi 20) Reiu jõgi 21) Saarjõgi 22) Seljajõgi 23) Tagajõgi 24) Valgejõgi 25) Vihterpalu jõgi 26) Vodja jõgi 27) Võhandu jõgi 28) Väike Emajõgi 29) Vääna jõgi 30) Õhne jõgi
(1) Karpkalalaste elupaikadena kaitstavate veekogude nimekirja on kantud veekogud, kus on tõugja (Aspius aspius), latika (Abramis brama), vimma (Vimba vimba), teivi (Leuciscus leuciscus), turva (Leuciscus cephalus) või säina (Leuciscus idus) kaitstavad elupaigad. (2) Karpkalalaste elupaikadena kaitstavad veekogud on järgmised:     Kood «Riigi veekatastris» 1) Emajõgi 2) Halliste jõgi 3) Kasari jõgi 4) Mullutu-Suurlaht 5) Narva jõgi 6) Pedja jõgi 7) Peipsi järv 8) Pärnu jõgi 9) Võrtsjärv 10) Väike Emajõgi
(1) Lõheliste ja karpkalalaste elupaikadena kaitstavate veekogude vee keemiline ja füüsikaline kvaliteet peab vastama järgmistele nõuetele: Kvaliteedinäitaja Kvaliteedinäitaja piirväärtus   Lõheliste veekogud Karpkalalaste veekogud Veetemperatuur (°C) Veetemperatuur soojuse väljutamise tagajärjel suublas ei tohi: – tõusta üle 1,5 °C; – ületada 21,5 °C; – ületada kalade paljunemisperioodil 10 °C. Veetemperatuur soojuse väljutamise tagajärjel suublas ei tohi: – tõusta üle 3 °C; – ületada 28 °C; – ületada kalade paljunemisperioodil 10 °C, kui veekogus esineb kudemiseks jahedamat vett nõudvaid kalaliike. Lahustunud hapnik (mg/l O2) 50% mõõtmistulemustest peavad andma tulemuse ≥ 9 50% mõõtmistulemustest peavad andma tulemuse ≥ 7 pH 6–9 6–9 Heljuvaine (mg/l) ≤ 15, üleujutuste korral >15 ≤ 15, üleujutuste korral >15 Bioloogiline hapnikutarve (BHT5) (mg/l O2) ≤ 5 ≤ 5 Üldfosfor (mg/l P) Jõgedes: ≤ 0,08 Järvedes: ≤ 0,06 Jõgedes: ≤ 0,08 Järvedes: ≤ 0,06 Üldlämmastik (mg/l N2) Jõgedes: ≤ 3 Järvedes: ≤ 0,7 Jõgedes: ≤ 3 Järvedes: ≤ 0,7 Fenool (µg/l C6H5OH) ≤ 5 ≤ 5 Naftasaadused (µg/l) ≤ 20 ≤ 20 Ammoonium (mg/l NH4) ≤ 0,3 ≤ 0,3 Jääkkloor (mg/l HOCl) 1. Vee reaktsioonil pH = 6: HOCl ≤ 0,5 2. Vee reaktsioonil pH >6: HOCl > 0,5 1. Vee reaktsioonil pH = 6: HOCl ≤ 0,5 2. Vee reaktsioonil pH > 6: HOCl > 0,5 Tsink (mg/l Zn) 1. Vee karedusel 10 mg/l CaCO3: Zn ≤ 0,03 2. Vee karedusel 50 mg/l CaCO3: Zn ≤ 0,2 3. Vee karedusel 100 mg/l CaCO3: Zn ≤ 0,3 4. Vee karedusel 500 mg/l CaCO3: Zn ≤ 0,5 1. Vee karedusel 10 mg/l CaCO3: Zn ≤ 0,3 2. Vee karedusel 50 mg/l CaCO3: Zn ≤ 0,7 3. Vee karedusel 100 mg/l CaCO3: Zn ≤ 1,0 4. Vee karedusel 500 mg/l CaCO3: Zn ≤ 2,0 Vask (mg/l Cu) 1. Vee karedusel 10 mg/l CaCO3: Cu ≤ 0,005 2. Vee karedusel 50 mg/l CaCO3: Cu ≤ 0,022 3. Vee karedusel 100 mg/l CaCO3: Cu ≤ 0,04 4. Vee karedusel 300 mg/l CaCO3: Cu ≤ 0,112 1. Vee karedusel 10 mg/l CaCO3: Cu ≤ 0,005 2. Vee karedusel 50 mg/l CaCO3: Cu ≤ 0,022 3. Vee karedusel 100 mg/l CaCO3: Cu ≤ 0,04 4. Vee karedusel 300 mg/l CaCO3: Cu ≤ 0,112 (2) Veekogudele, mis on kaitstavad nii lõheliste kui karpkalalaste elupaikadena, rakendatakse lõheliste veekogude vee keemilisi ja füüsikalisi kvaliteedinõudeid.
(1) Lõheliste ja karpkalalaste elupaikadena kaitstavate veekogude keemiliste ja füüsikaliste kvaliteedinäitajate määramissagedused on järgmised: Kvaliteedinäitaja Kvaliteedinäitaja määramissagedus Veetemperatuur (°C) Kord nädalas Lahustunud hapnik (mg/l O2) Kord kuus pH Kord kuus Heljuvaine (mg/l) Kord kvartalis Bioloogiline hapnikutarve (BHT5) (mg/l O2) Kord kvartalis Üldfosfor (mg/l P) Kord kvartalis Üldlämmastik (mg/l N2) Kord kvartalis Fenool (µg/l C6H5OH) Kord kvartalis Naftasaadused (µg/l) Kord kuus Ammoonium (mg/l NH4) Kord kuus Jääkkloor (mg/l HOCl) Kord kuus Tsink (mg/l Zn) Kord kuus Vask (mg/l Cu) Kord kvartalis (2) Fenooli, jääkkloori, tsinki ja vaske määratakse reostuskahtluse korral. (3) Temperatuuri mõõdetakse lõheliste ja karpkalalaste elupaikadena kaitstavates veekogudes, kuhu toimub soojuse väljutamine. (4) Kui lõheliste või karpkalalaste elupaikadena kaitstava veekogu kvaliteedinõuded on täidetud või veekogul moodustatud veekogumite füüsikalis-keemiliste üldtingimuste koondmäärang on vastavalt veeseaduse § 324 lõike 4 punkti 1 alusel kehtestatud keskkonnaministri määrusele vähemalt hea, võib käesoleva määruse § 5 lõikes 1 nimetatud kvaliteedinäitajate seiret teostada iga kuue aasta järel.