(1) Kaitsealal on keelatud: 1) uue maaparandussüsteemi rajamine; 2) looduslike veekogude veetaseme ja kaldajoone muutmine; 3) puhtpuistute kujundamine ja energiapuistute rajamine; 4) uuendusraie, välja arvatud turberaie, mille juures tuleb säilitada koosluse liikide ja vanuse mitmekesisus, ning uuendusraie pargis ja botaanikaaias; 5) biotsiidi ja taimekaitsevahendi kasutamine veepiirile lähemal kui 25 m, üleujutatavatel aladel, külmunud pinnasel, metsamaal ning looduslikul ja poollooduslikul rohumaal; 6) maavara kaevandamine.
(2) Kaitsealal on keelatud ehitise, kaasa arvatud ajutise ehitise püstitamine, välja arvatud: 1) Kochi piiranguvööndis ajaloolise Kochi mõisakompleksi taastamine; 2) Nehatu piiranguvööndis jõe kaldast vähemalt 100 m kaugusel; 3) Nehatu piiranguvööndis Ämma tee ääres maksimaalselt 8 m kõrguste eramute püstitamine; 4) Botaanikaaia piiranguvööndis taimekollektsioonide säilitamisega seotud rajatistekaitseala valitseja nõusolekul botaanikaaia tegevuseks vajalike ehitiste püstitamine ja hoonestatud katastriüksustele ehitiste püstitamine, kusjuures mõlemal juhul on keelatud ehitamine maakatastrisse kantud metsamaa kõlvikule ning hoonete kõrgus ei tohi ületada 10 meetrit; 5) Jõesuu piiranguvööndis spordiväljakute ehitamine; 6) kaitseala valitseja nõusolekul rajatiste rajamine kaitseala tarbeks; 7) kaitseala valitseja nõusolekul teede ja liinirajatiste rajamine.
(3) Kaitseala valitseja nõusolekuta on kaitsealal keelatud: 1) muuta katastriüksuse kõlvikute piire ja sihtotstarvet; 2) koostada maakorralduskava ja teostada maakorraldustoiminguid; 3) 4) 5) kehtestada detailplaneeringut ja üldplaneeringut; 6) lubada ehitada ehitusteatise kohustusega või ehitusloakohustuslikku ehitist, sealhulgas lubada püstitada või laiendada lautrit või paadisilda; 7) anda projekteerimistingimusi; 8) anda ehitusluba; 9) rajada uut veekogu, mille pindala on suurem kui viis ruutmeetrit, kui selleks ei ole vaja anda vee erikasutusluba, ehitusluba ega esitada ehitusteatist.