(1) Hiiu maakonnas võetakse kaitse alla järgmised merikotka püsielupaigad: 1) Ristna Kõrgessaare vallas Kalana külas; 2) Kõpu Kõrgessaare vallas Kiduspe külas; 3) Heinlaid Pühalepa vallas Sarve külas; 4) Suuremõisa Pühalepa vallas Valipe külas; 5) Vanamõisa Emmaste vallas Külama ja Sepaste külas; 6) Jõeranna Kõrgessaare vallas Jõeranna külas; 7) Malvaste Kõrgessaare vallas Malvaste külas; 8) Valgu Emmaste vallas Harju külas. 1 (1¹) Harju maakonnas võetakse kaitse alla järgmised merikotka püsielupaigad: 1) Kurkse Padise vallas Pedase ja Kurkse külas; 2) Praski Padise vallas Vintse ja Alliklepa külas. 1 (1²) Jõgeva maakonnas võetakse kaitse alla järgmised merikotka püsielupaigad: 1) Kaarepere Jõgeva vallas Kassinurme külas; 2) Kassivere Palamuse vallas Kassivere külas.
(2) Lääne maakonnas võetakse kaitse alla järgmised merikotka püsielupaigad: 1) Telise Noarootsi vallas Telise/Tällnäsi külas; 2) Näsi Vormsi vallas Suuremõisa külas; 3) Hobulaid Ridala vallas Hobulaiu külas; 4) 5) Puiatu Ridala vallas Sinalepa ja Puiatu külas; 6) Kiili Hanila vallas Massu külas; 7) Tuksi Noarootsi vallas Elbiku/Ölbäcki külas;. 8) Võigaste Lihula vallas Poanse külas.
(3) Põlva maakonnas võetakse kaitse alla merikotka Lüütja püsielupaik Mikitamäe vallas Laossina külas.
(4) Pärnu maakonnas võetakse kaitse alla järgmised merikotka püsielupaigad: 1) Haapsi Varbla vallas Haapsi külas; 2) 3) Pootsi Tõstamaa vallas Seliste külas; 4) Vaskrääma Paikuse vallas Vaskrääma külas ja Surju vallas Metsaääre külas; 5) Võigaste Lääneranna vallas Võigaste külas.
(5) 6
(6) Saare maakonnas võetakse kaitse alla järgmised merikotka püsielupaigad: 1) Stebeli Torgu vallas Sääre külas; 2) Tammuna Torgu vallas Sääre külas; 3) 4) 5) Paeranna Muhu vallas Lahekülas; 6) Või Muhu vallas Võikülas ja Kuivastu külas; 7) Muraja Pöide vallas Muraja külas; 8) Ruhve Laimjala vallas Randvere külas; 9) Tulpe Kaarma vallas Muratsi külas; 10) 11) Ruhnu Ruhnu vallas Ruhnu külas; 12) Kiruma Mustjala vallas Kiruma ja Küdema külas; 13) Kõiguste Laimjala vallas Kõiguste külas; 14) Nurme Leisi vallas Angla ja Nõmme külas; 15) Pammana Leisi vallas Murika külas; 16) Siiksaare Valjala vallas Turja külas. 6 (6¹) Tartu maakonnas võetakse kaitse alla järgmised merikotka püsielupaigad: 1) Haaslava Haaslava vallas Metsanurga külas; 2) Jättasoo Alatskivi vallas Saburi külas; 3) Meeksi Meeksi vallas Meeksi külas; 4) Savimetsa Alatskivi vallas Savimetsa külas; 5) Tähemaa Vara vallas Tähemaa külas.
(7) Viljandi maakonnas võetakse kaitse alla järgmised merikotka püsielupaigad: 1) Meleski Kolga-Jaani vallas Vaibla külas; 2) Valma Tarvastu vallas Riuma külas; 3) Kalbuse Tarvastu vallas Villa külas. 7 (7¹) Võru maakonnas võetakse kaitse alla järgmised merikotka püsielupaigad: 1) Kerretu Sõmerpalu vallas Mustassaare külas ja Rõuge vallas Tsirgupalu külas; 2)
(8) Püsielupaikade ja nende vööndite piirid on kantud kaartidele, mis on esitatud määruse lisas3.